MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 55991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015574	AAG	2	6	120229	120234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986341
2502	NC_015574	ACG	2	6	120304	120309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986341
2503	NC_015574	CTT	2	6	120399	120404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986341
2504	NC_015574	GTT	2	6	120471	120476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986341
2505	NC_015574	CAG	2	6	120496	120501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986341
2506	NC_015574	GAA	2	6	120511	120516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986341
2507	NC_015574	TTG	2	6	120517	120522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986341
2508	NC_015574	CTC	2	6	120682	120687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986341
2509	NC_015574	ATC	2	6	120695	120700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986341
2510	NC_015574	GGA	2	6	120713	120718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986341
2511	NC_015574	GAT	2	6	120723	120728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986341
2512	NC_015574	A	6	6	120778	120783	100 %	0 %	0 %	0 %	333986341
2513	NC_015574	CA	3	6	120880	120885	50 %	0 %	0 %	50 %	333986341
2514	NC_015574	AG	3	6	121000	121005	50 %	0 %	50 %	0 %	333986341
2515	NC_015574	TCC	2	6	121036	121041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986341
2516	NC_015574	CAA	2	6	121100	121105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986341
2517	NC_015574	AGA	2	6	121113	121118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986341
2518	NC_015574	TTA	2	6	121183	121188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986341
2519	NC_015574	GTT	2	6	121283	121288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986341
2520	NC_015574	CAAA	2	8	121304	121311	75 %	0 %	0 %	25 %	333986341
2521	NC_015574	T	7	7	121324	121330	0 %	100 %	0 %	0 %	333986341
2522	NC_015574	T	6	6	121338	121343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_015574	TTTTTG	2	12	121393	121404	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015574	ATG	2	6	121483	121488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986342
2525	NC_015574	GGA	2	6	121521	121526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986342
2526	NC_015574	GGC	2	6	121539	121544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986342
2527	NC_015574	GT	3	6	121566	121571	0 %	50 %	50 %	0 %	333986342
2528	NC_015574	AAT	2	6	121579	121584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986342
2529	NC_015574	A	6	6	121610	121615	100 %	0 %	0 %	0 %	333986342
2530	NC_015574	TCA	2	6	121669	121674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986342
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2532	NC_015574	CAG	2	6	121709	121714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2533	NC_015574	A	6	6	121847	121852	100 %	0 %	0 %	0 %	333986342
2534	NC_015574	A	6	6	121924	121929	100 %	0 %	0 %	0 %	333986342
2535	NC_015574	ACA	2	6	122045	122050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986342
2536	NC_015574	AACC	2	8	122052	122059	50 %	0 %	0 %	50 %	333986342
2537	NC_015574	A	6	6	122064	122069	100 %	0 %	0 %	0 %	333986342
2538	NC_015574	ACT	2	6	122154	122159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986342
2539	NC_015574	ACATAC	2	12	122201	122212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333986342
2540	NC_015574	TTC	2	6	122224	122229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986342
2541	NC_015574	GCA	2	6	122253	122258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2542	NC_015574	CA	3	6	122311	122316	50 %	0 %	0 %	50 %	333986342
2543	NC_015574	GCA	2	6	122380	122385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2544	NC_015574	CAG	2	6	122386	122391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2545	NC_015574	GTG	2	6	122399	122404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986342
2546	NC_015574	TA	3	6	122493	122498	50 %	50 %	0 %	0 %	333986342
2547	NC_015574	GA	4	8	122641	122648	50 %	0 %	50 %	0 %	333986342
2548	NC_015574	AGA	2	6	122676	122681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986342
2549	NC_015574	AAGG	2	8	122742	122749	50 %	0 %	50 %	0 %	333986342
2550	NC_015574	ACTGG	2	10	122897	122906	20 %	20 %	40 %	20 %	333986342
2551	NC_015574	CAGGA	2	10	122928	122937	40 %	0 %	40 %	20 %	333986342
2552	NC_015574	GAT	3	9	122992	123000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986342
2553	NC_015574	TGA	2	6	123081	123086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986342
2554	NC_015574	TCT	2	6	123093	123098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986342
2555	NC_015574	TGC	2	6	123188	123193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2556	NC_015574	GAT	2	6	123220	123225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986342
2557	NC_015574	A	6	6	123286	123291	100 %	0 %	0 %	0 %	333986342
2558	NC_015574	TTC	2	6	123314	123319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986342
2559	NC_015574	TAC	3	9	123412	123420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986342
2560	NC_015574	AGA	2	6	123467	123472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986342
2561	NC_015574	AGA	2	6	123480	123485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986342
2562	NC_015574	AT	3	6	123515	123520	50 %	50 %	0 %	0 %	333986342
2563	NC_015574	AAATA	2	10	123576	123585	80 %	20 %	0 %	0 %	333986342
2564	NC_015574	GAA	2	6	123694	123699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986342
2565	NC_015574	CAG	2	6	123739	123744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986342
2566	NC_015574	ATTA	2	8	123831	123838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015574	T	8	8	123839	123846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_015574	TTA	2	6	123856	123861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015574	ATAA	2	8	123884	123891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_015574	TTA	2	6	123892	123897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_015574	AAAT	2	8	123964	123971	75 %	25 %	0 %	0 %	333986343
2572	NC_015574	ATG	2	6	124039	124044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986343
2573	NC_015574	AAAAG	2	10	124061	124070	80 %	0 %	20 %	0 %	333986343
2574	NC_015574	TGA	2	6	124100	124105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986343
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2576	NC_015574	TGA	2	6	124136	124141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986343
2577	NC_015574	T	6	6	124166	124171	0 %	100 %	0 %	0 %	333986343
2578	NC_015574	GAT	2	6	124182	124187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986343
2579	NC_015574	AG	3	6	124288	124293	50 %	0 %	50 %	0 %	333986343
2580	NC_015574	AGA	3	9	124343	124351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986343
2581	NC_015574	AGA	2	6	124364	124369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986343
2582	NC_015574	AGA	2	6	124376	124381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986343
2583	NC_015574	AAG	2	6	124411	124416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986343
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2586	NC_015574	T	7	7	124774	124780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_015574	T	7	7	124821	124827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015574	TGA	2	6	124840	124845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015574	GAT	2	6	124939	124944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986344
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2591	NC_015574	CCA	2	6	124984	124989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986344
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2593	NC_015574	CAT	2	6	125033	125038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986344
2594	NC_015574	CAA	2	6	125042	125047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986344
2595	NC_015574	TCA	2	6	125180	125185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986344
2596	NC_015574	TGT	2	6	125213	125218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986344
2597	NC_015574	GGCAC	2	10	125455	125464	20 %	0 %	40 %	40 %	333986344
2598	NC_015574	GAG	2	6	125583	125588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986344
2599	NC_015574	TGGG	2	8	125604	125611	0 %	25 %	75 %	0 %	333986344
2600	NC_015574	T	6	6	125726	125731	0 %	100 %	0 %	0 %	333986344
2601	NC_015574	CT	3	6	125747	125752	0 %	50 %	0 %	50 %	333986344
2602	NC_015574	TGG	2	6	125754	125759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986344
2603	NC_015574	CAT	2	6	125774	125779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986344
2604	NC_015574	TTG	2	6	125825	125830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986344
2605	NC_015574	GTT	2	6	125877	125882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986344
2606	NC_015574	T	6	6	125885	125890	0 %	100 %	0 %	0 %	333986344
2607	NC_015574	T	8	8	125965	125972	0 %	100 %	0 %	0 %	333986344
2608	NC_015574	TAA	2	6	126087	126092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_015574	AAATAA	2	12	126122	126133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015574	A	7	7	126132	126138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015574	TTAATA	2	12	126183	126194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_015574	AAT	2	6	126253	126258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_015574	ATT	2	6	126297	126302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986345
2614	NC_015574	AG	3	6	126332	126337	50 %	0 %	50 %	0 %	333986345
2615	NC_015574	TGG	2	6	126423	126428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986345
2616	NC_015574	T	6	6	126457	126462	0 %	100 %	0 %	0 %	333986345
2617	NC_015574	AAC	2	6	126482	126487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986345
2618	NC_015574	CTG	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986345
2619	NC_015574	TAT	2	6	126641	126646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986345
2620	NC_015574	AG	3	6	126673	126678	50 %	0 %	50 %	0 %	333986345
2621	NC_015574	TTAT	2	8	126806	126813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_015574	T	7	7	126813	126819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_015574	TAA	2	6	126876	126881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_015574	CA	3	6	126941	126946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2625	NC_015574	A	8	8	126953	126960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_015574	A	7	7	126978	126984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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